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肿瘤研究整体课题解决方案
       亿鸣复兴现推出针对医学研究领域的整体解决方案,为您提供有关医学研究的众多技术服务以及各种各样的工具,包括基因SNP/突变、基因表达、基因调控、细胞增殖、细胞凋亡、细胞周期、细胞迁移、细胞侵袭等技术服务以及相关试剂产品
 
       

技术流程
 
   
我们的优势
     
       多组学一站式解决方案
       方案设计->样本制备->文库构建->测序服务->生物信息->功能验证->结果总结
 
    深度测序结合功能研究
  寻找低频变异和罕见变异

  挖掘变异对生物学功能的影响
         
  生物信息综合服务

       高级分析

     定制化分析

      数据挖掘
     专业咨询
 
     专业团队

   强大的测序能力和综合技术平台

     统计分析能力

研究方向和技术
 
 
主要技术
 
       测序技术
 
功能研究技术
       基因检测

       技术包括:SNP检测、荧光定量、基因沉默、基因过表达、基因合成。
 
       蛋白检测

       技术包括:Western Blot ELISA 蛋白组学检测
 
       免疫检测
      研究肿瘤的抗原性、机体的免疫功能与肿瘤发生、发展的相互关系,机体对肿瘤的免疫应答及其抗肿瘤免疫的机制、肿瘤的免疫诊断和免疫防治的科学,即研究肿瘤的发病机制、预防、诊断和治疗是肿瘤免疫学重要的一个分支。通过免疫学的方法——IHC,IF,IP 等方法进行肿瘤学研究,已经是非常重要的肿瘤研究技术手段。

       细胞检测
       技术包括:细胞增殖、细胞凋亡、细胞迁移、细胞侵袭、细胞周期检测等。
      
     其它技术-CAT-T分子构建
      我们使用iCarTab技术


样本
 
      实体瘤
     实体瘤样本是癌症研究的最重要样本来源。结合患者表型信息进行回顾性研究,发现更多癌症相关基因变异。前瞻性研究更有助于研究与治疗和预后相关的变异信息。

      ctDNA液体活检

       对液体活检样本比如血液、尿液cfDNA,为发现无创检验、早期诊断和动态监测生物标志物提供可靠和便利的取样方式。
 
       微生物

       来自肠道、皮肤等人体微生物与癌症的发生发展有关联,寻找微生物与癌症的关系是目前的研究热点。
  


案例分析1:
外显子组和全基因组测序发现新的驱动基因和信号通路因子




                  图示:左,各变异类型在人群样本中的分布。                                  右,非编码区变异及在样本中分布比例。

目前最大规模乳腺癌全基因组序列研究,分析了560个乳腺癌全基因组序列,鉴定出了与乳腺癌相关的93个基因以及其他一些非编码区的突变,同时绘制制了乳腺癌基因组突变的过程。

参考文献:Serena Nik-Zainal, et al. Landscape of somatic mutations in 560 breast cancer whole-genome sequences. Nature (2016).


案例分析2:靶向测序高效寻找治疗和预后方案相关变异




 
                  左图:EGFR不同突变频率对PFS的影响;                            右图:突变携带数量对PFS的影响。

癌症的分子异质性可以解释TKI 类药物对于治疗EGFR 突变的肺腺癌患者的不同疗效。通过二代测序技术,本研究检测了17 例EGFR 突变患者的FFPE 肿瘤样本中22 个癌症相关基因的突变状态,揭示了癌症的分子异质性,携带基因突变的数目与基因的突变频率影响肺腺癌患者的治疗效果。二代测序技术可以用于对癌症患者的有效分层并依次选择有针对性的治疗方法。
参考文献:Emilio Bria et al. Molecular heterogeneity assessment by next-generation 
sequencing and response to gefitinib of EGFR mutant advanced lung adenocarcinoma. Oncotarget. 2015


案例分析3:多组学联合分析发现病人精准分层生物标记物 指导预防、诊断、治疗和预后




左图:基因组测序发现与癌症病理分期与转移相关的基因变异;           右图:转录组测序发现基因表达水平与病灶转移的关系。


对一个多位置转移前列腺癌患者的回顾性样本进行基因组测序和转录组测序,发现了多个与转移相关的变异。对更多的样本进行综合分析有利于找到对癌症研究和治疗相关的分子标记物和精准方案。
参考文献:Bova GS, et al. Integrated clinical, whole-genome, and transcriptome analysis of multisampled lethal metastatic prostate cancer. CSH. 2016


案例分析4:研究微生物与癌症发生发展的关系





             图示:聚类分析发现菌群分布与子宫颈癌病理分型的关系。

参考文献:Astride Audirac-Chalifour, et al. Cervical Microbiome and Cytokine Profile at Various Stages of Cervical Cancer: A Pilot Study Plos One (2016)


案例分析5:遗传性肿瘤研究和风险评估
 
遗传性肿瘤综合征和风险评估:
 
遗传性肿瘤综合征是某些具有遗传倾向的癌症类型,通常发病年龄较早,由一个或多个基因的遗传突变造成,多为常染色体显性遗传。基因检测将为风险模型的建立和风险评估提供更多的依据,有助于判断哪些患者会受益于遗传咨询和风险管理。
 
遗传性肿瘤综合征56基因Panel



适用于家系研究


外显子组发现更多新的疾病相关位点
 
56个遗传易感基因实现快速和低成本筛查
 

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