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SNP/突变检测

      SNP,即单核苷酸多态性(SingleNucleotide Polymorphism,SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。与其它分子标记相比,SNP 分辨率最高也最为丰富,覆盖基因组范围大,遗传上比较稳定。

     在人类基因组中,估计平均每1,000 个碱基对就有1 个SNP,估计其总数可达300 万个甚至更多,是继微卫星之后的第三代遗传标记。SNP 分布不均匀,在非转录序列中要多于转录序列,绝大多数位于蛋白的非编码区。通常情况下是一种二等位基因的变异,多为转换,即一种嘧啶碱基换为另一种嘧啶碱基,或一种嘌呤碱基换为另一种嘌呤碱基,转换与颠换之比为2:1。SNP 在CG 序列上出现最为频繁,而且多是C→T,因为CG 中C 即胞嘧啶常被甲基化,自发脱氨后即变为胸腺嘧啶。

     SNP 技术服务平台:测序分型、Taqman 探针分型、MultiplexSNaPshot 分型、飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)分型、LDR(高温连接酶法)分型、HRM(高分辨率熔解曲线)分型等技术平台。亿鸣复兴技术平台涵盖了从低通量、中等通量到高通量的完整SNP分型平台,能满足不同规模项目的需求,为您量身打造个性化的服务。

     我们的服务:

     1. 测序法

     在所有SNP的检测方法中,对欲检测片段进行直接扩增、测序是最为准确的方法。通常情况下,纯合型SNP位点的测序峰为单一峰型,而杂合型SNP位点的测序峰为套峰,因而很容易将其区分开来,并且检出率接近100%。

     2. 探针法

     针对SNP位点设计1对PCR引物和1条TaqMan探针(该探针的5’端和3’端分别标记报告荧光基团和淬灭荧光基团),进行实时荧光PCR。当溶液中有PCR产物时,该探针与模板退火,产生适合于核酸外切酶活性的底物,从而将探针5’端的荧光基团切割下来,破坏两荧光分子间的PRET,发出荧光,最终达到检测SNP位点的目的。

     3. SNaPshot法

     该技术基于荧光标记单碱基延伸原理,主要针对中等通量的SNP分型检测。在一个含有测序酶,四种荧光标记ddNTP,紧挨多态位点5’端的不同长度延伸引物和PCR模板的反应体系中,引物延伸一个碱基即终止,经ABI测序仪电泳后,根据峰的颜色可知掺入的碱基种类,从而确定该样本的SNP位点。通常用于5-30个SNP位点分析。

       点击如下链接下载SNP信息登记表:

      http://www.ymbio.com/uploadfile/2015/0728/20150728052406634.docx

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